İlk sürüngenler, yaklaşık 320 milyon yıl önce Karbonifer Dönemi'nde ortaya çıkmıştır. Bilinen en eski olası sürüngen/amniyot cinslerinden biri, fosilleri Kanada'daki Joggins Kömür Kayalıkları'nda bulunan küçük, kertenkele benzeri bir canlı olan Hylonomus'tur. Sürüngenlerin (ve amniyotların) evrimindeki en büyük devrim, amniyotik yumurtanın ortaya çıkışıdır. Bu yumurta, embriyoyu sıvı dolu bir zar içinde koruyan ve dışındaki sert veya derimsi kabuk sayesinde kurumayı önleyen bir yapıya sahipti. Amniyotik yumurta, sürüngenleri üremek için suya bağımlı olan amfibilerden (iki yaşamlılar) ayırdı. Karbonifer'in dev kömür ormanlarının nemli ortamlarında başlayan bu serüven, sürüngenlerin pullu derileriyle birlikte karaların kurak iç bölgelerine yayılmasına ve sonraki dönemlerde Dünya'nın baskın omurgalı grubu haline gelmelerine olanak tanıdı.